U.O.C. Microbiologia - Dipartimento di medicina Interna

L’Unità Operativa Complessa di Microbiologia e Virologia (UOC MV) è un laboratorio mono-specialistico, riservato alla patologia infettiva. La struttura è compresa nel Piano per la Riorganizzazione delle strutture che erogano prestazioni di laboratorio nella Regione Lazio (D.C. R. Lazio. N.8 del 23 gennaio 2009).

UOC Microbiologia e Virologia è nata nel 1997, come risposta all’esigenza di dedicare stabilmente un gruppo di operatori alle aree specialistiche della virologia (molecolare e immuno-diagnostica) e della batteriologia clinica. La struttura si è poi modificata per affiancare le necessità Dipartimento di Emergenza (DEA), dell’area critica (terapie intensive), la progressiva specializzazione di alcuni reparti ospedalieri, la ristrutturazione della Commissione Infezioni Ospedaliere (CIO).

UOC Microbiologia e Virologia è strutturata come laboratorio “DEA-compatibile” (operativo su 12 ore, dal lunedì al sabato e suscettibile di pronta disponibilità notturna e festiva). L’offerta è rivolta ai pazienti interni e ai pazienti esterni. Per gli esterni l’accesso alle prestazioni avviene tramite il CUP, senza prenotazione; il prelievo o la consegna dei materiali biologici è effettuabile – come per qualunque altro tipo di analisi cliniche - in uno dei tre ambulatori prelievi aziendali: San Filippo Neri, Salus Infirmorum, S. Andrea.

UOC Microbiologia e Virologia è un laboratorio dotato di elevati livelli di informatizzazione. La richiesta d’indagini microbiologiche dai reparti è effettuata mediante interfaccia web; lo stesso software è utilizzabile anche per la visualizzazione e la stampa in reparto dei referti “firmati elettronicamente”. Un sistema analogo gestisce i collegamenti con gli ambulatori prelievi esterni. Attualmente la maggior parte delle richieste e dei referti si muove nella via informatica. Il sistema gestionale di laboratorio presiede all’intero processo lavorativo: accettazione, check-in dei campioni, pianificazione del lavoro, collegamento con le strumentazioni, refertazione, etc. La gran parte dei campioni di virologia (immmuno diagnostica) è lavorata direttamente su provetta primaria (prelevata al paziente); lo stesso accade per le emocolture. I barcode sono utilizzati anche per identificare i campioni secondari e le piastre per colture.

Il referto è prodotto al termine di un processo che prevede tre livelli di controllo (validazione tecnica, clinica; firma elettronica). L’automazione strumentale riguarda diverse lavorazioni del laboratorio: ricerca di anticorpi e antigeni, ricerca di acidi nucleici microbici e virali, colture e identificazioni microbiche, etc

Con l’eccezione di un ristretto numero di dispositivi, le strumentazioni analitiche, i materiali e i reagenti della
UOC. Microbiologia e Virologia sono acquisiti mediante gare di service: ciò garantisce una buona innovazione tecnologica, ma anche continuità delle linee produttive servizi regolari di manutenzione delle apparecchiature.

Il laboratorio persegue una politica di miglioramento della qualità, con particolare attenzione alle procedure di prelievo dei campioni biologici (codificate secondo un manuale periodicamente aggiornato)e alla lavorazione secondo linee guida e tecnologie accreditate. I dirigenti di UOC Microbiologia e Virologia svolgono attività scientifica e formativa nel campo della microbiologia clinica

Dal gennaio 2011, nella UOC Microbiologia e Virologia, gli antibiogrammi sono eseguiti e refertati in accordo alle linee guida europee EUCAST (http://www.eucast.org/). Occorre ricordare che il sistema di riferimento EUCAST è attualmente l'unico standard per antibiogramma riconosciuto dalla European Medicines Agency (http://www.ema.europa.eu), l'istituzione che autorizza l'immissione dei farmaci in tutti i Paesi dell'Unione Europea.

In concomitanza con l’adozione delle regole EUCAST, allo scopo di migliorare le prescrizioni antibiotiche (anche per pazienti esterni), il laboratorio si è anche dotato di un sistema informatico esperto. Il sistema controlla, in modo flessibile, la “visibilità” degli antibiotici di maggiore impatto ecologico presenti nell’antibiogramma. Con questo progetto, il team della UOC Microbiologia e Virologia intende rendere operative le indicazioni sull’uso prudente degli antibiotici promossa dall’AIFA (http://www.agenziafarmaco.gov.it/ “Antibiotici. Difendi la tua difesa” ), dall’Istituto Superiore di Sanità e dal Ministero della Salute.

Il laboratorio esegue e registra con regolarità il controllo di qualità (QC) interno per sierologia, immunodiagnostica e biologia molecolare; utilizza ceppi standard per il QC batteriologico; aderisce da anni - per un ampio ventaglio di linee (vedi tabella) - al programma di controllo qualità esterno (VEQ) gestito dal “United Kingdom National External Quality Assesment Service” (vedi tabella).

Metodiche per le quali è continuamente attivo il controllo qualità esterno (VEQ) www.ukneqasmicro.org.uk
AAFB microscopy	Anti-HBs detection	Hepatitis B DNA quantification
Anaerobe survey	Hepatitis B serology	Hepatitis C RNA detection
Antimicrobial susceptibility	Hepatitis C serology	Virus identification
General bacteriology	HIV serology
Mycobacterium culture	Immunity screen
Mycology	Rubella IgG serology
Faecal parasitology	Syphilis serology
	Toxoplasma IgM serology
	Toxoplasma IgG serology
	Diagnostic serology exanthem
	Diagnostic serology hepatitis

Dal 2000, la UOC. Microbiologia e Virologia lavora in stretta collaborazione con la Direzione Sanitaria e con la commissione per il controllo delle infezioni ospedaliere (CIO) www.sanfilipponeri.roma.it/cio.

Report periodici su epidemiologia di microrganismi e resistenze antibiotiche vengono prodotti per supportare interventi preventivi o regolare la terapia empirica. In laboratorio, è attivo un sistema giornaliero di allerta su microrganismi sentinella e sospetti episodi epidemici.

Nel 2003 la Microbiologia, insieme con altre strutture dell’ospedale, è stata onorata dall’assegnazione del "premio Regionale all'eccellenza in Sanità per il sistema di sorveglianza attiva delle infezioni ospedaliere in area intensiva"

Dal 2007, l’UOC MV ha aderito al progetto pilota nazionale di sorveglianza basata sui dati di laboratorio Micronet (CCM) http://micronet.cineca.it. Nel 2011, i dati di sorveglianza delle resistenze microbiche del S. Filippo, raccolti attraverso il protocollo Micronet, fluiscono all’Istituto Superiore di Sanità (progetto AR-ISS) e, successivamente, al centro europeo delle malattie infettive ECDC (http://www.ecdc.europa.eu).

La struttura anima da anni l’attività scientifico-formativa della "SEERBIO FONDAZIONE ONLUS", un gruppo interdisciplinare attivo a livello regionale nella prevenzione delle infezioni ospedaliere (www.fondazioneseerbio.org).

Alla fine del 2010 la struttura è stata individuata quale sede della sezione regionale di SIMPIOS (http://www.simpios.org), la società scientifica italiana per lo studio e la prevenzione delle infezioni ospedaliere.