L'Azienda Complesso Ospedaliero SAN FILIPPO NERI è stata riconosciuta come ospedale di rilievo nazionale e di alta specializzazione per le attività svolte, soprattutto nel campo della  neurochirurgia e neurologia intensiva, cardiologia e cardiochirurgia, pneumologia e oncologia. E' sede di Dipartimento di Emergenza ed Accettazione (D.E.A.) di 2° livello. Centro di Riferimento Regionale per l'Oncologia, la Cardiologia, la Chirurgia Vascolare, e la Neurochirurgia.

E' presente un centro di Nutrizione Clinica ed una Unità Valutativa Alzheimer. E' attivo il modello organizzativo Dipartimentale.

Attualmente, in attesa che si completi la ristrutturazione degli edifici A e B dell'ospedale San Filippo Neri, sia dal punto di vista edile che impiantistico,  sono complessivamente attivi circa 750 posti letto. 
E' stato completato il nuovo edificio C, che consente una più funzionale utilizzazione dei servizi, soprattutto nel settore dell'Emergenza.

L'Azienda Ospedaliera San Filippo Neri è costituita dai seguenti presidi:

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